Die Fahrzeuge kannan meistens einfach löschen, dann geht es wieder.
Verhindern kann man sowas nicht, außer man baut die kompletten Straßen um.
Von einzelnen Mods auf generelle Probleme in EM4 und 5 zu schließen ist schon gewagt. Mir wäre aus 20 Jahren EM4 (he, wieso wird dieser Runde Geburtstag eigentlich nicht gefeiert?) nicht bekannt, dass man Fahrzeuge einfach löschen kann.
Und "Straßen umbauen" ist vor allem in EM4 auch nicht so ganz der richtige Ausdruck.
Um zurück auf die Anfrage zu kommen:
Geht es um bestimmte Mods? Geht es um das Original Spiel? In welchem Kontext bleiben sie stehen? Kreuzungen, Kurven oder einfach auf gerader Strecke?
Auf jeden Fall sind Emergency 4 und 5 technisch komplett anders, somit muss man hier 2 verschiedene Probleme angehen.